對于棉籽油，一直存在兩極的觀點：

觀點一：不能吃。有人認為棉籽油是從種棉籽中壓榨而得的油脂，是很強的殺精藥物，可造成生精細胞損害，導致睪丸萎縮，而無精子產生，嚴重情況下會造成不育。如果是女性食用棉籽油的話，就有可能出現月經不調等等的；生殖系統疾病。女性出現月經不調或閉經以及子宮萎縮。

觀點二：當然能吃 。不過得精煉的，現在的生產工藝完全能去除其中有害物質 ，其實棉籽油可有效地預防心臟動脈變窄、心腦血管疾病，動脈硬化，血栓形成；軟化心腦血管、促進血液循環、降脂降壓、促進新陳代謝、調節內分泌和減緩衰老等， 同時棉油是優秀的煎炸油，不僅耐煎，而且煎炸產品上色好，產品顏色金黃亮麗，色澤誘人，食欲口感俱佳. 很高的亞油酸含量， 可有效降低膽固醇和防止動脈粥樣硬化，對心腦血管疾病具有很好的預防作用。這類不飽和脂肪酸主要是亞油酸，對人體新陳代謝、調節血壓和維持平衡等起著重要作用，還能有效抑制血液中膽固醇上升，有“血管清道夫”的美譽。人體對棉籽油的吸收率達到98％以上，可廣泛用于烹調食用。