侏儒癥由于多種原因導致的生長素分泌不足而致身體發育遲緩。侏儒癥病因可歸咎于先天因素和后天因素兩個方面。臨床上分為特發性和繼發性，以前者為多，占全部垂體性侏儒癥的60-70%，后者因下丘腦-垂體的器質性病變所致，主要有顱咽管瘤，松果體瘤等。先天因素多由于父母精血虧虛而影響胎兒的生長發育，多數與遺傳有關，一般智力發育正常。后天多與藥物、營養不良有關。具體原因如下：

1、骨骼系統疾病如軟骨營養不良和抗維生素D性佝僂病。

2、染色體異常如先天性愚型（21一三體綜合征），貓叫綜合癥（5號染色體短臂缺失）和先天性卵巢發育不良癥。

3、先天性酶的代謝缺陷如粘多糖病和肝糖原累積癥。

4、內分泌障礙如垂體性侏儒癥，甲狀腺功能減退(克汀病)。垂體侏儒的病因有兩種，一種是原發性，病因不明，部分屬遺傳性疾病。一種是繼發性，即由于垂體周圍組織有各種病變，包括腫瘤，如顱咽管瘤、垂體黃色瘤等;感染如腦炎 、腦膜炎 、 結核病 ;血管病變及外傷。

5、腎臟疾病如腎小管性酸中毒和范可尼綜合征等。

6、家族性矮小癥和原發性侏儒癥，體質性生長發有延緩或青春期延遲。

7、長期大劑量的腎上腺皮質激素的應用。