輸卵管畸形是在發育過程中沒有按照正常的發育，出現一些小障礙，導致了輸卵管的畸形，這個在臨床中還是很少見的，從輸卵管畸形上一般從外面開始，輸卵管畸形大部分是內生殖器器官，外生殖器官還有性發育異常引起的，比如說陰蒂增大，或者是會陰體特別高，還有女性雖然是有陰道，但是陰蒂很大，像小陰莖等等，臨床醫學不討論類似情形，因為染色體的異常或激素的異常而導致的輸卵管畸形是無法治療的。

機械性輸卵管畸形是有一些脫落的栓子及器官的功能性收縮所造成的。常見的栓子有月經期的內膜碎片、血凝塊，藥物流產及人工流產時由于子宮收縮及流產時的子宮付壓吸引的突然解除，引起胚胎組織及胚胎附屬物進入輸卵管造成輸卵管畸形。還有的是由于輸卵管液的固縮引起輸卵管畸形，計劃生育中所進行的輸卵管粘堵術等；輸卵管受到一些刺激時會發生功能性痙攣致開口及管腔收縮而形成輸卵管的畸形。不過在機械性輸卵管畸形中這樣的機會機會還是少見的，最常見的是在不孕癥病因尋找時進行輸卵管畸形檢查時所引起，如輸卵管通液檢查，輸卵管造影檢查，腹腔鏡下輸卵管美蘭通液等，由于醫生技術操作粗暴，技術操作不成熟；或由于患者自身對痛疼過于敏感等所引起輸卵管間質部痙攣造成的輸卵管畸形發育。