第一、微波食品產生致癌化合物。曾有研究表明，微波過的肉類會產生致癌物；牛奶、水果、麥片中的氨基酸也會在微波后轉化為致癌物；蔬菜中的植物生物堿同樣會在微波后轉化成致癌物危害我們健康。有些塑料在受熱的時候可能會釋放出一些有害的成分。美國食品藥品管理局（FDA）測定了各種塑料容器在正常微波爐加熱中可能釋放到食物中的有害物質的量，要求這個量低于動物實驗確定的有害劑量的百分之一甚至千分之一，才可以標注為“可微波加熱”。所以，對于那些標注為“可微波加熱”的合格塑料容器，是相當安全的。如果不放心，還可以使用陶瓷或者玻璃容器。

第二、食物營養嚴重流失。微波爐烹煮的食物會使蔬菜中的礦物質、維生素及營養成分極大的減少，或轉變成致癌物。

第三、身體會暗中產生一定的變化。如荷爾蒙失調，淋巴和消化系統紊亂，血液和免疫力異常，情緒低落、記憶退化，永久性腦損傷，甚至還會引發心臟病。

同時，若微波爐使用不當也會發生安全事故。最常見的以下兩類事故：

1，液體過熱。微波加熱時由于水不流動，只是溫度升高，有可能超過了沸點還“不開”，出現過熱現象。這個時候的水只要有一點擾動，就會猛烈沸騰，容易發生燙傷事故。越干凈的容器和越干凈的水，越容易發生這樣的事故。

2，雞蛋爆炸。微波爐不能加熱雞蛋，因為雞蛋內部過熱會產生較大壓力，受到到外界干擾，壓力釋放，可能會發生爆炸。

微波爐對的風險表現在它的加熱能力，這種能力作用于人體同樣會帶來傷害。質量合格的微波爐，通過內部的屏蔽裝置來降低泄露出的微波能量。

科學研究找到了對人體產生傷害的最小微波功率，以此制定了微波爐泄漏功率的標準。例如美國的規定是，在距離微波爐大約5厘米的地方，每平方厘米的功率不超過5毫瓦；我國的標準更加嚴格，是1毫瓦。而且微波的能量是按照距離的平方減弱的。以5厘米處1毫瓦計算，50厘米處就降低到了百分之一毫瓦。因此只要是合格的微波爐產品，使用中沒有損壞，就不會泄漏出能夠傷害人體的微波。

因為微波是一種輻射，有一種錯誤的觀點認為它會致癌。事實上，微波是一種電磁波，跟收音機和電報所用的電波、紅外線、以及可見光本質上是同樣的東西。它們的差別只在于頻率的不同。微波的頻率高于電波，低于紅外線和可見光。處于這一頻率波段的電磁波是不會致癌的。

雖然同樣被稱作“輻射”，但微波與跟X光、放射性同位素產生的輻射等是不一樣的。后兩者屬于較危險的電離輻射，而微波屬于非電離輻射，二者危險性并不相同。X光雖然也是電磁波，但是其頻率比微波高得太多，因而能量也高；而放射性同位素在衰變過程中會放射出粒子，所以它們能讓生物體產生癌變。

(1)在使用微波爐之前，小心讀清楚制造商隨爐附送的使用說明書，認識你的微波爐，并接納指示。

(2)電源若不足，爐內的光線會顯得暗淡，此時若繼續使用，會損壞安全保險設備，應立即停止。

(3)微波爐要放置在通風的地方，附近不要有磁性物質，以免干擾爐腔內磁場的均勻狀態，使工作效率下降。微波爐應該平放，遠離爐火及水龍頭。爐后或兩側通風之處切勿蓋住，最好與墻壁起碼有5厘米（2英寸）的距離，使熱氣易于散發。還要和電視機、收音機離開一定的距離，否則會影響視、聽效果。

(4)微波爐內如無物品，切勿使用。因為發出的微波無法吸收，會反彈回磁控管而加以損壞。家中如有小孩，或為防止一時疏忽而造成空載運行，可在爐腔內置一盛水的玻璃杯。

(5)在使用轉盤式微波爐時，盛裝食品的容器一定要放在微波爐專用的盤子中，不能直接放在爐腔內。

(6)一定要關好爐門，確保連鎖開關和安全開關的閉合。微波爐關掉后，不宜立即取出食物，因此時爐內尚有余熱，食物還可繼續烹調，應過1分鐘后再取出為好。

(7)如微波爐門有凹痕或者有任何損壞致關不牢，不應使用。定期檢查爐門四周和門鎖，如有損壞、閉合不良，應停止使用，以防微波泄漏。門鉸若發覺不妥，立即著人修理。不宜把臉貼近微波爐觀察窗，防止眼睛因微波輻射而受損傷。也不宜長時間受到微波照射，以防引起頭暈、目眩、乏力、消瘦、脫發等癥狀，使人體受損。

(8)大部分微波爐在爐腔內的右側有微波饋入口，一般用云母或塑料片遮擋，必須定期（建議使用微波爐10次左右）用濕布擦洗干凈，否則濺在上面的食物殘渣易被炭化，引起微波反射，燒壞磁控管。

(9)門縫或開門之處，切勿遺留食物碎屑或油漬，致爐門不能密關。

(10)微波爐宜常保持清潔及干爽，爐內如有水氣會減低效能，應盡量拭干。

(1)忌用普通塑料容器：一是熱的食物會使塑料容器變形，二是普通塑料會放出有毒物質，污染食物，危害人體健康

(2)忌超時加熱：食品放入微波爐解凍或加熱，若忘記取出，如果時間超過2小時，則應丟掉不要，以免引起食物中毒。

(3)忌將肉類加熱至半熟后再用微波爐加熱：因為在半熟的食品中細菌仍會生長，第二次再用微波爐加熱時，由于時間短，不可能將細菌全殺死。冰凍肉類食品須先在微波爐中解凍，然后再加熱為熟食。

(4)忌再冷凍經微波爐解凍過的肉類：因為肉類在微波爐中解凍后，實際上已將外面一層低溫加熱了，在此溫度下細菌是可以繁殖的，雖再冷凍可使其繁殖停止，卻不能將活菌殺死。已用微波爐解凍的肉類，如果再放入冰箱冷凍，必須加熱至全熟。

(5)忌油炸食品：因高溫油會發生飛濺導致火災。如萬一不慎引起爐內起火時，切忌開門，而應先關閉電源，待火熄滅后再開門降溫。

(6)忌將微爐置于臥室，同時應注意不要用物品覆蓋微波爐上的散熱窗柵。

(7)忌長時間在微波爐前工作：開啟微爐后，人應遠離微波爐或人距離微波爐至少在1米之外。

(8)忌與其他電器共用同一插座，要用單一電源而且裝接了地線的插座。

(9)忌用微波爐暖嬰兒的牛奶，因為牛奶熱得不均勻時，容易灼傷嬰兒。另外會使牛奶的營養成分破壞。

(10)忌用微波爐去烘干衣服或者把硬化的指甲油煮軟，以防起火。

(11)忌徒手去移出微波爐內的食物。盛器及蓋子加熱后往往積聚了蒸氣，又會吸收食物的熱氣，而變得十分燙手，應該用防熱手套或墊子，以防灼傷。

（12）不允許無含水食物放置微波爐內而使微波爐工作，這樣會導致微波爐損壞。