1、消化器官未完全成熟。

由于1—2歲的寶寶生長發育特別迅速，所以，身體需要的營養及熱能較多。然而，消化器官卻未完全發育成熟，分泌的消化酶較少。因此，消化能力較弱，容易發生腹瀉。

2、神經系統對胃腸的調節功能差。

由于神經系統對胃腸的調節功能差，所以飲食稍有改變，如對添加的離乳食品不適應、短時間添加的種類太多，或一次喂得太多、突然斷奶；或是飲食不當，如吃了不易消化的蛋白質食物；氣溫低身體受涼加快了腸蠕動、天太熱，消化液分泌減少及秋天溫差大、小肚子易受涼等，都可引起腹瀉。

3、全身及胃腸道免疫力較低。

由于全身及胃腸道免疫力較低，所以只要食物或食具稍有污染，便可引起腹瀉；寶寶因抵抗力較低而易發生呼吸道感染，在患感冒、肺炎、中耳炎時，也常可引起腹瀉。