肺炎雙球菌是一種常見的細菌，是引起肺炎、中耳炎的一種細菌。肺炎雙球菌的分類一般根據其莢膜多糖抗原來進行分類。也有科學家在其分類中研發出了疫苗，這也是幼兒常接受的一種疫苗。

根據莢膜多糖抗原的不同，可將其分為若干血清型，其中Ⅰ～Ⅲ型致病力較強，Ⅲ型最強，且具有厚的莢膜，可作為鑒別此菌的依據。由2000年開始，美國建議使用一種七價的肺炎鏈球菌結合疫苗，適合2－23個月大的嬰兒或2－5歲有存在風險的孩童。這種疫苗每2、4、6及12－14個月大會使用一次。可以保護孩童免受肺炎鏈球菌的深層感染，如敗血病及腦膜炎。相似的九價疫苗則在測試中。

另外，根據其表面的光滑程度也可以進行分類。肺炎雙球菌(Diplococcus pneumoniae)是一種病原菌，存在著光滑型(Smooth簡稱S型)和粗糙型(Rough簡稱R型) 兩種不同類型。其中光滑型的菌株產生莢膜，有毒，在人體內它導致肺炎，在小鼠體中它導致敗血癥，并使小鼠患病死亡，其菌落是光滑的。而粗糙型的菌株不產生莢膜，無毒，在人或動物體內不會導致病害，其菌落是粗糙的。肺炎雙球菌有多種株系，但只有光滑型菌株可致病，因為在這些菌株的細胞外有多糖莢膜起保護作用，不致被宿主破壞。