1、如果在早孕期發現巨細胞病毒感染，可以選擇人工流產終止妊娠。也可以等到妊娠20周時，抽羊水檢查免疫球蛋白(IgM)。如果檢查結果顯示陽性，表示羊水已經受到感染，這就表示胎兒可能已經合并感染了巨細胞病毒，此時可以選擇中斷妊娠進行引產，避免胎兒出生后有畸形情況。

2、如果孕婦在孕晚期感染了巨細胞病毒，或者發現巨細胞病毒已經從宮頸管分離出，可以不做處理。等胎兒足月后，可選擇經陰道分娩。但在孕晚期的感染并不能說明胎兒是否有感染的情況，很有可能新生兒尿液中隱藏了巨細胞病毒，最好使用一次性尿布，或用過的尿布做消毒處理。

3、若在乳汁中檢測出巨細胞病毒，在產后最好不要母乳喂養，改用人工喂養比較適合。