1、取男性尿道分泌物或刮片標本，或女性宮頸內膜標本，作革蘭染色和淋球菌培養檢查，無淋球菌的證據。

2、涂片檢查

（1）對于男性患者，取尿道分泌物涂片，作革蘭染色檢查可見多形核白細胞。

（2）對于女性患者，用拭子取宮頸管內膜標本，涂片，作革蘭染色，可觀察到多形核白細胞。

3、沙眼衣原體檢測：有細胞培養法、直接免疫熒光法、酶免疫法和抗原快速檢測法。如果檢測結果陽性，對非淋菌性尿道炎有診斷意義。

4、解脲支原體檢測：男性患者解脲支原體培養陽性，結合病史和其他實驗室檢查，有助于非淋菌性尿道炎的診斷。