1、在無痛人流手術進行的過程中，由于在吸取孕囊時，容易造成子宮宮腔負壓力突降，過大的壓力容易造成子宮內膜異位癥，以及宮頸粘連，導致不孕癥的發生。如果無痛人流手術過程中利用麻醉類藥劑，雖然減輕了病人身體上的痛苦也帶來了很多并發癥，有的麻醉時患者會出現呼吸困難、窒息等癥狀。

2、在無痛人流手術后，麻醉藥物可能會在患者的體內殘留，病人可能出現頭暈、乏力等癥狀，有的還會出現腹部疼痛等全身癥狀，有些過敏體質的患者，更容易出現麻醉反應。

3、無痛人流危害還表現在無痛人流術后護理方面，患者多會出現月經不調，或感染其它子宮炎癥的狀況，術后需要進行長時間的恢復以及治療，對患者的工作以及生活造成了一定的影響，尤其是如果意外懷孕錯過了無痛人流的最佳治療時間必須要通過引產的方式進行解決，對女性身體的傷害更加嚴重。而且過多的無痛人流還會造成習慣性流產。