試管嬰兒最主要的適應癥是輸卵管阻塞不通，一般輸卵管完全阻塞的患者才做試管嬰兒的，做試管嬰兒也需要有成熟的卵子。多囊卵巢本來就卵巢功能低下，沒有成熟卵泡形成，得不到卵子（或沒有質量好的卵子），因此無法做試管嬰兒或大大降低試管嬰兒的成功率。

多囊卵巢綜合癥會引起長期慢性的雄激素水平上升，導致一系列代謝異常，血脂代謝受到影響，年輕的女性患者就會出現心血管問題；糖代謝異常，出現胰島素抵抗，誘發糖尿病。此外，子宮內膜無法脫落，還可能誘發子宮內膜癌等。

多囊卵巢的病因很多，而由此引發的卵巢性綜合癥不孕的治療是較為困難和復雜，所以要先到醫院做更詳細的檢查，尋找根本的病因，進行更好的治療才能收獲良好的治療效果。建議多囊卵巢患者應及早治療，而不是在沒有治愈的情況下，不要盲目的去做試管嬰兒。