變性人和人妖是兩種不同的概念，人們容易混淆。變性人和人妖的區別主要有以下幾點：

1、性別

變性人完全摘除或作掉了變性之前的性器官。而人妖只是男性從小服用了大量的雌激素所導致的第二性征發育變態，但還是男性。

2、性取向

變性人是因為心理異性化，男女都有，因為各種心理原因而轉化了自己的性別，包括了摘除自己的性器官和移植異性的性器官。由于雌性激素的影響，人妖的性取向多為男性(男性向)。

3、身體改變

以男變女的變性人為例，變性之后陰莖和陰囊被完全摘除，尿道也被移位。但為了保持女性的身材，必須定期服用雌激素來維持，身體需要一段很長的時間來適應。

人妖男性生理特征便逐漸萎縮，如男性生殖器，就會變得又短又小，而皮膚就會變得細潤，有光澤，臀部，胸部會越發達，像女性一樣，肌肉減少，皮下脂肪增多，皮膚富于彈性，胸乳增長快的，比普通女性還高聳，渾圓。

4、壽命

人妖壽命不長，這是因為人妖需要長期的、大劑量的使用激素，使身體激素維持在高水平。人妖壽命的長短與激素劑量的大小有關。而變性人通過手術摘除性器官，術后只會輔助性地用一些雌性激素，劑量相比之下少很多，對壽命的影響也沒那么大。