適用于藥物治療后癥狀不緩解、局部病變加劇或生育功能未恢復者，較大的卵巢內(nèi)膜異位囊腫者。首選腹腔鏡手術法。手術方式有：

1、保留生育功能手術：切凈或破壞所有課件的異位內(nèi)膜病灶、分離粘連、恢復正常的解剖結構，但保留子宮、一側或雙側卵巢，至少保留部分卵巢組織。

2、保留卵巢功能手術：切除盆腔內(nèi)病灶及子宮，保留至少一側或部分卵巢。適用于癥狀明顯且無生育要求的45歲以下患者，術后復發(fā)率約5%。

3、根治性手術：將子宮、雙附件及盆腔內(nèi)所有異位內(nèi)膜病灶予以切除和清除，適用于45歲以上重癥患者。

手術和藥物聯(lián)合治療：手術治療前給予3-6個月的藥物治療，使異位病灶縮小、軟化，有利于縮小手術范圍和手術操作。對保守性手術、手術不徹底或術后疼痛不緩解者，術后給予6個月的藥物治療，推遲復發(fā)。