與很多美容手術一樣，激光脫毛也是存在一定風險的。激光脫毛的危害是與激光脫毛采用的激光有關系的。

在強大的激光面前，皮膚簡直就是一張透明的玻璃紙，因而激光能非常順利地透過皮膚深達毛囊。由于毛囊中具有很多黑色素，所以能優先吸收大量的激光能量并最終轉換成熱能，使毛囊溫度升高，達到破壞毛囊功能的目的。在這個過程中由于皮膚相對不吸收激光能量，或者吸收很少量的激光能量，所以皮膚本身不會有損傷。

由于脫毛激光只會破壞生長期的毛囊細胞，對于休止期及退化期的毛囊并沒有完全破壞，所以部分毛囊會再生。因此激光脫毛須經三、四次療程才能做到永久脫毛，每次治療須間隔一個半月到二個月。