任何事物都是有兩面性的，艾灸具有如此多的作用，這其中必然也會有一些副作用。

1、艾灸的副作用主要表現在錯誤的判斷了身體的體質，錯誤的選擇了施灸的穴位，從而造成的身體的不適，經過正確的方法指導是可以調節過來的。

2、艾灸具有效果明顯、簡便易行、經濟實用的優點,幾乎沒有什么毒性和副作用,只要操作方法得當，穴位掌握準確，對人體一般不會產生不良反應。艾灸為身體補充陽氣，尤其適用于陽虛體質。

3、艾灸有補瀉的作用，對于陰虛火旺熱癥體質的人，要先從瀉法開始，滋陰的同時再調理陰陽的平衡。也就是施灸的穴位和方法有所不同。

4、如果操作不當，也可能會產生不適，就會被理解是所謂的艾灸的副作用，建議應該到專業的地方進行指導。比如專業的艾灸養生館。

5、艾灸是一種物理和藥理結合的中醫療法。是綠色自然療法，起源于中國古代，是艾草制成的艾絨燃燒來治病養生的方法。

6、但由于體質和癥狀不同，開始施灸可能引起發熱、疲倦、口干、全身不適等反應，一般不需顧忌，繼續施灸即能消失。