干眼癥患者最主要的癥狀是眼部感覺有異物感、干燥感、眼癢，外界刺激、感情沖動不流淚，畏光，絲狀粘性分泌物增多，眼痛及燒灼感，疲勞感，結膜反復充血，痙癢感，視力波動等。有六成患者癥狀為感覺到持續性異物感和眼干燥感，其次有三成患者癥狀是感覺到疲勞感、畏光。另外，如果淚液產生不足或蒸發過多均可引起眼部刺激癥狀，產生燒灼感。

干眼癥患者晚期眼表面組織可出現增厚、潰瘍或瘢痕形成、新生血管生長等癥狀。如果角膜形成瘢痕，則可引起視力下降。

假如患者常時間干眼沒有得到治療，較嚴重者眼睛會出現紅腫、充血、角質化、角膜上皮破皮而有絲狀物黏附等癥狀，這種損傷日久則可造成角結膜病變，并會影響日后視力。