像任何縱隔腫瘤一樣，胸腺瘤的臨床癥狀產生于對周圍器官的壓迫和腫瘤本身特有的癥狀——合并綜合征。

小的胸腺瘤多無臨床主訴，也不易被發現。腫瘤生長到一定體積時，常有的癥狀是胸痛、胸悶、咳嗽及前胸部不適。癥狀遷延時久，部分病人行X線檢查，或某些病人在體查胸透或攝胸片時發現縱隔腫物陰影。被忽略診斷的胸腺瘤此時常生長到相當大體積，壓迫無各靜脈或上腔靜脈梗阻綜合征的表現。劇烈胸痛，短期內癥狀迅速加重，嚴重刺激性咳嗽，胸腔積液所致呼吸困難，心包積液引起心慌氣短，周身關切骨骼疼痛，均提示惡性胸腺瘤或胸腺癌的可能。

胸腺瘤特有的表現是合并某些綜合征，如重癥肌無力(MG)、單純紅細胞再生障礙性貧血(PRCA)、低球蛋白血癥、腎炎腎病綜合征、類風濕性關節炎、皮肌炎、紅斑狼瘡、巨食管癥等。

大約50%胸腺瘤病人無明顯臨床癥狀，多是在胸部X線體檢時被查出腫瘤。隨著腫瘤增大或腫瘤的外侵，患者表現為局部壓迫癥狀、全身反應及伴發疾病癥狀。胸壁受累病人可陸續出現程度不等胸背鈍痛、肩胛間區或胸骨后疼痛;氣管受壓出現咳嗽、氣促、胸悶、心悸等呼吸困難癥狀;喉返神經受侵可出現聲音嘶啞，膈神經受壓可出現膈肌麻痹;上腔靜脈梗阻表現為面部青紫、頸靜脈怒張。如出現乏力、盜汗、低熱、消瘦、貧血、嚴重的胸痛以及心包積液、胸腔積液等體征常提示為惡性病變或伴有局部轉移。