慢性咽炎經常因為急性咽炎治療不徹底而導致反復發作轉成慢性，或因慢性鼻炎、鼻竇炎的長期刺激，或孩子長期偏嗜辛辣厚味、飲料等，或食積、便秘等誘因導致發病。慢性咽炎主要分為慢性單純性咽炎、慢性肥厚性咽炎、萎縮性咽炎或干燥性咽炎。主要因為以下幾方面的原因造成：

1、氣候及地域環境變化：溫度、濕度的變化、空氣質量差、辛辣刺激性食物、粉塵、有害氣體及放射性照射也是導致兒童慢性咽炎的原因。特別是城市里的孩子，每天吸入更多的尾氣，污染等等，所以爸媽要保證孩子所在的房間空氣新鮮，若開空調，則需要定時的開窗更換新鮮空氣。霧霾天氣時，盡量讓孩子留在家中，如果要外出最好給孩子帶了口罩再出門。

2、經常哭鬧：孩子若長期大量用聲哭鬧及易感體質因素也會引起慢性咽炎。

3、全身因素：如貧血，消化不良，胃食道反流，心臟病（因血液循環障礙影響咽部靜脈回流造成咽部局部淤血），慢性支氣管炎，支氣管哮喘，風濕病，肝、腎疾病等，也可引發慢性咽炎。內分泌紊亂，自主神經失調，臭鼻桿菌及類白喉桿菌的感染，維生素缺乏及免疫功能紊亂等均與萎縮性及干燥性咽炎相關。

4、過敏因素：吸入性過敏原（包括季節性與常年性過敏原），藥物、工作環境中的化學刺激物及食物過敏原都可以引起變應性咽炎。